Okul binası Balıkesir eşrafından Fatma – Emin KUTVAR çifti tarafından yaptırılarak Milli Eğitimin hizmetine sunulmuştur. Bina 1995 – 1996 öğretim yılında Müdür Vekili, iki memur ve bir hizmetli ile İlköğretim okulu olarak faaliyete başlamış ancak öğrenci kaydı yapılmamıştır. Milli Eğitim Bakanlığımızın 13 Mart 1996 tarih ve 03344 sayılı kararıyla okulun adı FATMA EMİN KUTVAR ANADOLU LİSESİ olarak değiştirilmiştir. Okulumuz 1996 – 1997 öğretim yılında 2 İngilizce ve 1 Almanca şubesi olmak üzere üç sınıfa toplam 108 öğrenci kaydı yapılarak eğitim öğretime başlamıştır. Halen 13 şube, 301 öğrenci, 28 öğretmen ve 2 idareci ile eğitime devam etmektedir.
Okulumuz 10.000 m² lik bir alan üzerine inşa edilmiş olup, bahçemizde bir futbol sahamız ve 2010 yılında yapımı tamamlanan bir kapalı spor salonumuz bulunmaktadır.
